KIURI 바이오인공지능센터

KIURI Bio-AI 센터

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바이오인공지능센터 소개

아주대학교 KIURI 바이오인공지능센터(AKB-AI, Center of Ajou KIURI Bio-Artificial Intelligence)는 의생명정보학 및 인공지능 기반 전문 기술을 바탕으로 연구자들에게 바이오메디컬 빅데이터의 분석 서비스, 협력 연구 및 관련 기술 교육을 수행하기 위한 목적으로 설립되었습니다.

바이오인공지능센터는 전문적인 의생명정보학, 딥러닝 기반 AI 분석 연구 인력 및 연구 인프라(대용량 클러스터 서버, 분석 도구 등)을 확보하여 바이오 데이터베이스 구축, 생명의과학 통합 지식베이스 구축, 정량적 분석 방법(인공지능, 데이터마이닝, 전산통계학 등) 생명정보학 통합적 분석 방법론을 바탕으로 각 연구자가 보유한 멀티오믹스 데이터에 대한 심도 있는 분석 서비스, 관련 기술 교육 및 협력 연구를 제공하고 있습니다.

바이오인공지능센터는 다양한 의생명과학 연구자와의 협력을 통하여 질병 중심 중개 연구를 수행하여, 질환 극복 기술, 의약 선도기술 등을 개발하는 초융합 연구를 진행할 것입니다.

센터의 기능과 목표

  • AI 기반 질병 중심 중개 연구를 위한 생명정보학 기술 개발
  • 생명 의료 데이터 분석 기법 교육
  • 연구 설계 상담
  • 생명 의료 데이터 분석 서비스 및 협력 연구
  • 혁신적인 AI 기술 기반 의료생명 데이터 분석 기술 개발
  • 다양한 협력 연구를 통한 초융합 연구 선도
  • 실험 연구자의 생물정보학적데이터 분석 기술 소양 증진
  • 연구 맞춤 생명의료정보 데이터 분석 서비스 제공을 통한 질환 극복 로드맵 제공
  • Research Consultant

    연구 목적에 맞는 시퀀싱 기법 및 데이터 분석 방법 맞춤 설계

  • Research

    생명의료정보학 및 인공지능 기술을 기반으로 전산 약리학, 다중 오믹스 데이터 통합 및 단일 전사체 분석 기술 개발 연구 및 다양한 협력 연구 수행

  • Analytical service

    각 연구 목표에 따른 세밀하고 정확한 맞춤 분석 제공

  • Education

    시퀀싱 데이터 분석 기술을 포함한 다양한 오믹스 데이터를 분석할 수 있는 생명의료정보학 분석기술을 교육

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  • 연구원 성명

    이수연

  • 연구분야

    바이오/인공지능

  • 직위

    연구전담조교수

  • 주요이력
    • 2021.08 가톨릭대학교 연구교수
    • 2019.12 한국기초과학지원연구원 Post-Doc
    • 2016.02 서울대학교 생물정보학 박사
  • Office Hours

    Monday to Wednesday (AM09:00 ~ PM 03:00)

키워드

computational pharmacology, multi-omics integration, computational personalized medicine, AI-biomedical informatics

소개

이수연 박사는 박사과정 동안 개인 유전체 변이 기반 개인별 맞춤 약물 권고 알고리즘을 개발하였고 이를 논문과 5개국 특허를 출원하였으며 이 외에도 RNA-editing site 동정 및 주석처리 소프트웨어, RNA-seq 분석 소프트웨어 등 다양한 biomedical 소프트웨어를 개발하였습니다. 또한 개인의 임상, 멀티 오믹스 데이터, 라이프로그 데이터를 활용하여 질병 예측 알고리즘 개발, 임상-라이프로그 온톨로지 개발등 다양한 어플리케이션을 개발하여 개인 의료 데이터 분석 플랫폼에 이식하였습니다. 박사 후 과정 동안에는 유전체, 전사체, 단백체를 기반으로 약물 재창출 알고리즘 개발, 단백체 변이 동정 및 주석처리 프로그램 개발, 암유전체 분석 등 다양한 연구를 수행하였습니다. 현재는 멀티 오믹스 및 딥러닝 기술 기반 약물 재창출 알고리즘 개발과 단일 세포 전사체 데이터 분석을 진행하고 있습니다. 최종적으로는 딥러닝 기술 기반 단일 세포 전사체 및 멀티 오믹스 데이터를 활용한 개인별 맞춤 약물 권고 및 약물 재창출 알고리즘을 개발하는 것이 목표입니다.

Publications (이수연 박사)

  • Soo-Youn Lee, Han Wang, Hae Jin Cho, Ruibin Xi & Tae-Min Kim (2022). The shaping of cancer genomes with the regional impact of mutation processes. Experimental & molecular medicine, 54(7)
  • Park, J*., Lee, S. Y.*, Baik, S. Y*., Park, C. H., Yoon, J. H., Ryu, B. Y., & Kim, J. H. (2020). Gene-Wise Burden of Coding Variants Correlates to Noncoding Pharmacogenetic Risk Variants. International journal of molecular sciences, 21(9), 3091.
  • Hwang, H., Jeong, H. K., Lee, H. K., Park, G. W., Lee, J. Y., Lee, S. Y., ... & Kim, J. Y. (2020). Machine learning classifies core and outer fucosylation of N-glycoproteins using mass spectrometry. Scientific reports, 10(1), 1-10.
  • Lee, S. Y*., Song, M. Y*., Kim, D., Park, C., Park, D. K., Kim, D. G., ... & Kim, Y. H. (2020). A Proteotranscriptomic-based computational drug-repositioning method for Alzheimer’s Disease. Frontiers in pharmacology, 10, 1653.
  • Lee, S. Y*., Hwang, H*., Kang, Y. M., Kim, H., Kim, D. G., Jeong, J. E., ... & Yoo, J. S. (2019). SAAVpedia: identification, functional annotation, and retrieval of single amino acid variants for proteogenomic interpretation. Journal of Proteome Research, 18(12), 4133-4142.
  • G.J. Kim*, S.Y. Lee*, J.H. Park, B.Y. Ryu, J.H. Kim, Role of Preemptive Genotyping in Preventing Serious Adverse Drug Events in South Korean Patients, Drug Saf 40(1) (2017) 65-80.
  • J.H. Lim*, S.Y. Lee*, J.H. Kim, TRAPR: R Package for Statistical Analysis and Visualization of RNA-Seq Data, Genomics Inform 15(1) (2017) 51-53.
  • S.Y. Lee, C.H. Park, J.H. Yoon, S. Yun, J.H. Kim, GEE: An Informatics Tool for Gene ExpressionData Explore, Healthc Inform Res 22(2) (2016) 81-8.
  • K.H. Lee, S.Y. Baik, S.Y. Lee, C.H. Park, P.J. Park, J.H. Kim, Genome Sequence Variability Predicts Drug Precautions and Withdrawals from the Market, PLoS One 11(9) (2016) e0162135.
  • S.Y. Lee, J.G. Joung, C.H. Park, J.H. Park, J.H. Kim, RCARE: RNA Sequence Comparison and Annotation for RNA Editing, BMC Med Genomics 8 Suppl 2 (2015) S8.
  • H.H. Kim, S.Y. Lee, S.Y. Baik, J.H. Kim, MELLO: Medical lifelog ontology for data terms from self-tracking and lifelog devices, Int J Med Inform 84(12) (2015) 1099-110.
  • S.Y. Lee, J.M. Kim, S.Y. Cho, H.S. Kim, H.S. Shin, J.Y. Jeon, R. Kausar, S.Y. Jeong, Y.S. Lee, M.A. Lee, TIMP-1 modulates chemotaxis of human neural stem cells through CD63 and integrin signalling, Biochem J 459(3) (2014) 565-76.
  • Lee, S. Y. & Kim, J. H. Bioinformatics Approaches for the Identification and Annotation of RNA Editing Sites. Journal of Genetic Medicine 10, 27-32 (2013).
  • J.H. An, S.Y. Lee, J.Y. Jeon, K.G. Cho, S.U. Kim, M.A. Lee, Identification of gliotropic factors that induce human stem cell migration to malignant tumor, J Proteome Res 8(6) (2009) 2873-81.
  • Lee, S. Y. , S.Y. Baik, Kim, J. H. “Method and system for selecting drug on basis of individual protein damage information for preventing side effects of drug” 1020140107916, 14/912,397, 14838351.6, 2016-536029,201480046187.7